之后祖凤凰强撑着飞回明离火山，在火山极深处涅盘，破而后立，修为更进一步，达到半步混元大罗。但由于损失部分先天本源，导致形态发生改变，代表阳刚的凤面完全消失，只剩下代表阴柔的凰面，至此凤凰族以凰为尊。
后在道祖鸿钧证道后，同样意识到神道即将走向没落，玄门仙道即将崛起，带领飞禽众属精锐力量前往洪荒大世界边缘的混沌内开辟凤凰界。走之前于南明火山深处开辟明离洞天，留下两界通道供族人进出，由金凤凰镇守两界通道。并留下九转凤凰诀和凤凰涅盘诀以及配套宝地涅盘池，可供天下飞禽化凰和提升血脉。
后圣母娘娘证道混元圣人时，金凤凰将镇守两界通道职责交给火凤凰，自己前来投奔，甘愿认主侍奉。
祖麒麟是三族之中唯一修行地元素的先天神灵，相比起修行水元素的祖龙和修行火元素的祖凤凰，对于西方地脉爆炸，祖麒麟首当其冲，受到的伤害是三人中最重的。
祖麒麟是走神道修炼方式的先天大神，或者说，这个时期的先天神灵基本上都是走神道修行之路。
而祖麒麟还是地元素的方面的先天神灵，西方地脉爆炸，就相当于他职责履行失责。
正所谓：太初有道，神与道合。太古初期，神道盛行，先天神灵都是应运而生，肩负着镇压和梳理世界气运和能量的职责，各个都底蕴深厚，气运绵长，都有各自的先天传承和先天伴生灵宝，也都明悟自己先天使命和职责。
职责即权柄，先天伴生灵宝既是权柄的象征。先天神灵在修炼和参悟与自己先天传承、伴生灵宝和权柄方面的大道法则时，往往事半功倍。因此，既是为了自身修炼，亦是为了职责权柄，先天大神基本上都是修行自己的先天传承。
但任何事物都有好坏两面性，先天神灵在修行神道享受修行速度一日千里，权柄威能无限、法力无边的同时，其责任和受到的约束也是同等的。
先天神灵镇压天地气运和梳理世界能量，在职责权柄未完成之前，需要时时刻刻都小心注意履行自己的职责。
一旦职责在你镇压完成之前时出现纰漏，不仅自己道途受阻，其本身也得以身镇压。自此画地为牢，亿万年不得脱身。严重的甚至直接身死道消，真灵回归天地，彻底灰灰了。
因此，祖麒麟为了避免造成最坏结果，安排白虎镇守西方，负责梳理西方暴乱的能量和法则，并以自身大道法则为引，先天伴生灵宝麒麟印为阵眼，布下混土镇压大阵，更是安排所有麒麟族前往洪荒各地镇守地脉。
祖麒麟本人在回到不周山附近的麒麟祖地时，肉身化作麒麟崖，镇压中央大陆地脉，真灵损耗殆尽，遁入大地深处。既是为了镇压地脉，也是通过地脉恢复自身。
做完这一切后，祖麒麟再也支撑不住，陷入永久沉睡，唯有等待洪荒地脉恢复，方可有苏醒的一日。